Kwestią przesunięcia obowiązku wprowadzenia dokumentacji elektronicznej ze względu na opóźnienia we wprowadzaniu i wdrażaniu systemu zajęła się Naczelna Rada Lekarska. NRL domaga się ekspertyz ze strony Ministerstwa Zdrowia, wskazujących na jakim etapie jest wprowadzanie systemu.
Środowisko lekarskie broni się przed ponoszeniem odpowiedzialności prawnej czy ekonomicznej za wdrażanie systemu, który nie jest prawidłowo i dostatecznie przygotowany. Podstawą wniosku NRL jest przeprowadzona kontrola NIK, o której pisaliśmy wcześniej. NRL zamierza również wystąpić o opinię ekspertów z branży informatycznej, a w przypadku stwierdzenia niesprawności systemu na tym etapie przygotowania go, rada będzie wnioskować o nowelizację ustawy. Według pierwotnych zamierzeń, od 1 lipca 2014 roku lekarze obligatoryjnie powinni używać dokumentacji medycznej. Jednak NRL chce przesunięcia tej daty co najmniej o pół roku.
